De module biologische waterkwaliteit verwerkt de aquatische opnames. De taxonomische hiërarchie en de kenmerken van zowel meetpunten als de taxa kunnen aangesproken worden in de selectieprocedures. Hierdoor biedt deze module de eindgebruiker een grote flexibiliteit in het aanmaken van (presentie-) kaarten en tabellen. De opgeslagen gegevens zijn tevens de basis voor allerlei toetsen, waaronder de KRW toetsing. In combinatie met de fysisch/chemische waterkwaliteitgegevens heeft de gebruiker de mogelijkheden om responsieberekeningen in de vorm van tabellen of box-whisker diagrammen te presenteren.